#1 Le 19/02/2006, à 16:56
- mezhoud
install un paquet.tar.gz et le rendre les applications exécutables
nom prgm est blast.tar.gz. contenant deux applications : blastall et formatdb.
après décompression et dépackatage:
blast.tar.gz --> blast.tar --> bin data doc
et dans le /bin il y a des deux applications blastall et formatdb.
Il a fallu crée des liens avec ces applications et le shell en faisant :
set path= ( ~/bin $path )
ln -s ~/bin/blast/blastall ~/bin
ln -s ~/bin/blast/formatdb ~/bin
et insérer dans .bashrc ça:
set path= ( ~/bin $path )
setenv BLASTMAT = ~/bin/blast/data.
=====> je n'ai pas réussi à créer le lien entre les application et le bash.
question
1- la syntax est elle juste?
2- set commande non reconnue!!
merci
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#2 Le 19/02/2006, à 17:24
- mezhoud
Re : install un paquet.tar.gz et le rendre les applications exécutables
solutions: problème de syntax avec le bash qui n'aime pas les espaces et aime les cotes.
insérer dans .bashrc ça:
set path= '( ~/bin $path )'
setenv BLASTMAT = ~/bin/blast/data
et exécuter l'application pas dans /home mes dans /home/bin où se trouve les applications.
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